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医院现有员工1993人。其中拥有中国科学院院士1人、国家杰青6人、国家优青4人，上海市领军人才（含海外）11人，上海市优秀学术/技术带头人15人，医师人数590人，高级人数308人，博士生导师63名，硕士生导师60名。医院以临床需求为导向，坚持“四个面向”，聚焦于重大眼科学和耳鼻喉科学基础研究和转化应用，取得了丰硕的成果。医院承担的各级科研项目逐年增加，其中包括国家重点基础研究（973）项目、国家重大研发计划、国家杰青和优青项目等。近五年，医院获得各类科研项目649项。其中科技部重点研发计划、国家自然科学基金重大、重点项目、国家自然科学基金面上和青年等项目202项。研究成果发表科研论文超2000篇，其中在The Lancet、BMJ、Nature Medicine、Nature Biotechnology、Nature Genetics、Nature Communications、Immunity、Circulation、Advanced Materials、Science Translational Medicine、Cell Research和Cell Discovery等高影响力杂志上发表SCI论文100多篇。获得专利授权238项。研究成果荣获国家技术发明二等奖、国家科学技术进步二等奖、教育部自然科学一等奖、上海市科技进步一等奖、上海市技术发明一等奖、上海市青年科技杰出贡献奖等高层次奖项。2022年，医院耳聋基因治疗团队研发出针对OTOF先天性耳聋的基因治疗物，开展了首个先天性耳聋基因治疗临床试验，成功纠正聋哑患儿听力和言语，2024年发表于顶级医学期刊The Lancet和Nature Medicine，并被The Lancet选为封面导读，被同行评论为“开启了耳聋基因治疗新时代”。医院眼眶病眼肿瘤多学科综合诊疗团队，聚焦高危单眼视网膜母细胞瘤患者的治疗探索，历经十余年严谨而系统的临床研究，给高危视网膜母细胞瘤患儿带来福音。2024年发表于《美国医学会杂志》（JAMA），该期刊认为这项研究对罕见肿瘤治疗具有重大意义。
在复旦大学附属中山医院就医，第三方陪诊机构可提供陪诊服务，以帮助患者地完成就医过程。陪诊师会全程陪同患者就诊，提供咨询、指导、协助等服务。诊前指导:陪诊师会提前了解患者的病情、病史和用情况，为患者提供针对性的指导和建议。他们会提醒患者准备好相关资料和物品，以确保顺利就诊。
诊中服务:陪诊师会协助患者挂号、取号、排队候诊等，减少患者的等待时间和焦虑感。在问诊过程中，陪诊师还会与医生进行有效沟通，帮助患者地理解医生的诊断和治疗方案。
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试点工作安排（一）工作方案申报（2025年1月底前）。试点区门会同卫健部门依据试点方案，结合本区陪诊服务工作基础情况，制订老年人助医陪诊工作方案并向市民政报送。
（二）组织开展试点（2025年2月至7月）。试点区按照工作方案，组织开展试点工作，及时梳理分析工作推进难点，并研究解决。
（三）总结推广实施（2025年底前）。市民政会同市卫生健康委对试点情况进行整体评估，总结有效经验做法，制订全市面上实施文件，在全市推开。
陪诊人员会根据医院的科室分布、挂号规则、各类检查排队情况、自助机器的使用、缴费以及相关科室会诊情况，给用户提供更优、时间更少的就诊体验。3.用户在提交订单时，为顺利取得联系确保完成服务，请提交真实的用户信息及联系方式。
4. 如陪诊订单支付后因个人原因临时不能按时就诊，请尽早取消（至少三个工作日15:00前）。一个账号一周内累计取消超过两次，医生在线将自动暂停该账号未来14天的陪诊服务。
陪诊行业的监管与标准化进程
2023年《医疗服务辅助人员管理办法》明确规定:陪诊员不得穿仿护士制服、禁止使用"医疗顾问"等误导性称号。收费标准实行公示制度，代挂号服务需保留三年服务记录。北京上海等地试点陪诊员星级评价体系，与医院安检快速通道权限挂钩。行业协会正在制定《陪诊服务合同范本》，明确11项服务边界和6项免责条款。预计2025年将实现全国统一资格认证考试，持证上岗率要求达到80%以上。
医院设有眼科、耳鼻喉科、眼耳鼻整形外科、放疗科、麻醉科、急诊科、口腔科、护理部八个临床科室和放射科、病理科、剂科、检验科、临床营养科五个医技科室。医院现有汾阳、宝庆、浦江、浦东四个院区，统一管理，提供同质化服务。汾阳院区位于上海市徐汇区汾阳路83号，占地33亩；宝庆院区位于上海市徐汇区宝庆路19号，占地2.4亩；浦江院区位于上海市闵行区江月路2600号，占地100亩；浦东院区位于上海市浦东新区耀华路389号，占地3.3亩。医院核定床位数894张，实际开放床位数755张。2024年总门诊量超329万人次，手术量超19.3万，医疗辐射全国各地。